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[e-News Vol.9] 연구실 탐방 : 한양대학교 생물정보및유전체 연구실
작성자 관리자

 

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연구실 탐방 : 한양대학교 생물정보및유전체 연구실
작성자
남진우 교수
1. 연구소 개요

 본 생물정보및유전체 연구실 (BIoinformatics and Genomics, BIG Lab)은 한양대학교 생명과학과에 소속되어 있으며, 다양한 흥미로운 생물학적/의학적 문제를 해결하기 위해 다학제적인 (생물학/전산학/통계학/정보학/수학) 접근 방법을 통해 연구하는 그룹입니다. 특히 전산생물학, 기계학습기반 생물정보학, 유전체 분야에 많은 연구 경험과 기술을 바탕으로 1) 여러 핵심적인 생물학적 질문을 찾아내고, 2) 그것을 해결하기 위해 다양한 차세대 서열 분석 (Next-generation sequencing, NGS)기반 Dry&Web 실험을 설계하며 3) 생산된 대규모 데이터 분석을 위한 알고리즘, 프로그램, 파이프라인을 개발하고, 4) 이를 이용하여 대규모 NGS 데이터를 분석함으로써, 제기된 생물학적 질문의 답을 찾아 가고 있습니다. 특히, 본 연구실에서는 전장 유전체/전사체의 서열의 어셈블리, 유전체 서열/구조 변이 분석, Noncoding 유전자 동정 및 발현, 기능 및 메커니즘 연구에 관심을 갖고 있으며, 이러한 기초연구를 통해 축적된 지식과 방법론을 바탕으로 희귀질환 및 암유전체 분석, 동물 유전체 분석에 응용하고 있습니다. 좀더 자세한 연구내용은 홈페이지를 통해 확인할 수 있습니다. (http://big.hanyang.ac.kr)

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2. 수행중인 프로젝트 소개

​(1) 긴 비번역 RNA의 선택적 스플라이싱에 의한 암 발생 기전 연구 (연구책임, 중견과제)
본 연구는 긴 비번역 RNA (lncRNA)의 선택적 스플라이싱의 조절과 이에 작용하는 RNA Binding Protein의 동정을 통해 lncRNA의 기능을 규명하고, 특히 암조직에서 특이 조절되는 Alnternative splicing isoform의 동정과 암 조절 기전의 규명을 목표로 한다. 

(2) 고정밀 암 진단을 위한 멀티오믹스 기반 유전체변이 발굴 및 진단용 소프트웨어 플랫폼 개발 (참여, 다부처유전체)
본 연구는 암전장유전체 데이터로부터 고효율적인 변이 (체세포돌연변이, 구조변이, 융합유전자) 예측 프로그램을 개발하고 이를 임상적으로 적용하는 데 목표를 두고 있다. 

(2) 멀티오믹스 기반 전사체 플랫폼 개발 (참여, 다부처유전체)
다양한 멀티오믹스 데이터와 다양한 플랫폼의 데이터를 분석할 수 있는 고효율 생물정보툴을 개발하는 것을 목표로 함. 

3. 교수님 소개 및 대표 논문

 남진우 교수는 연세대학교에서 생물학을 전공하였고, 서울대학교에서 생물정보학 공학석사 및 이학박사 (2007년) 학위를 하였다. 학위 과정동안 서울대학교 컴퓨터 공학부 바이오지능 연구실과 (장병탁 교수님) 생명과학부 microRNA 연구단 (김빛내리 교수님)에서 생물정보학을 이용한 인간 유전체내의 microRNA관한 연구를 수행 하였다. 미국 MIT 대학의 Whitehead 연구소에서 박사후 연구원으로 재직하며(Advisor: David P. Bartel), 차세대 서열 분석 (Next-generation sequencing, NGS)을 이용한 다양한 regulatory ncRNA의 연구를 국제 저명 학술지인 Cell, Mol Cell, Genome Research 등에 발표하였다. 

최근 대표논문은 링크를 통해 확인할 수 있다: https://coya75.wixsite.com/biglab/international-papers-c1h9o

4. 연구실 단체사진 및 구성원 이름

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PI: 남진우     

Staff (3명):  랩메니저, 연구교수 1명, 박사후과정 1명

석박사통합과정: 7명

박사과정: 1명

석사과정: 4명

인턴: 1명

 

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