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[e-News Vol.7] 프로젝트 No.5 대장암 단일세포 전사체 데이터를 활용한 암의 진화과정 추적
작성자 관리자

 

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2020년 정밀의료기술개발사업단 연구 프로젝트 소개
연구주제
대장암 단일세포 전사체 데이터를 활용한 암의 진화과정 추적
연구책임자
박웅양 소장(삼성서울병원)
핵심연구원
김영욱(삼성서울병원)
작성자
김영욱(삼성서울병원)

대장암 종양조직에서 분리한 암세포의 단일 세포 RNA sequencing 결과를 사용하여 유전변이와 전사체 변화의 상관관계를 추적하는 알고리즘 개발을 목표로 한다.
이를 통해 tumor evolution 과정의 genomic coordination을 확인하고자 한다.


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위 그림과 같이 대장암 샘플을 고시퀀싱 용량으로 단일 세포 전사체 자료를 생산하고, 함께 생산된 전장 유전체 자료를 이용하여 다양한 변이 정보를 추출했다.
전사체 bulk RNA 시퀀스상에서 확인되는 변이 정보를 같이 확인했고, 단일 세포 유전체 자료로부터 유전변이와 전사체 변화의 상관 관계를 추적하는 알고리즘을 개발했다.
암 진화 과정에서 발생하는 여러 가지 유전체 변이 자료와 임상적 데이터를 결합하여, 암 진화 과정을 분자적 차원으로의 재구성을 목표로 한다.

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