연구실 탐방 : 삼성유전체연구소(2세부)/ 연구책임자 박웅양

 작성자

 홍유래(삼성유전체연구소) 

 1. 연구소 소개

  환자에게 가장 정확한 진단과, 가장 적합한 치료를 제공하기 위해서는 각 개인의 유전체를 분석해 환자에게 최적의 치료를 진행하는 것이 필수적이다. 삼성유전체연구소는 환자의 유전체 정보를 통해 환자 별 맞춤의료를 선도하려는 목적으로 개소되었다. Next generation sequencing을 이용해 여러 유전체 정보를 생산하며 여러 생물정보학적 기법을 이용해 환자의 예후-예측과 유전질환의 원인 돌연변이 등을 발굴하고 있다. 또한 단일세포 전사체 데이터를 통해 환자의 종양이질성 및 종양미세환경세포를 분석해 환자의 맞춤의료에 기여하고 있다. 이를 위해 여러 유전체 전문가, 임상의가 함께 연구를 진행중이다.

<Sequencing Platform> 

■ 4 Illumina sequencers ( 3 HiSeqs and 1 MiSeqs)

■ CancerSCAN™ using Agilent Bravo automated library preparation system

■ Single-cell genome analysis platform : C1 (Fluidigm), Chromium (10x Genomics)

■ High-throughput screening platform with liquid handler

 2. 교수님 소개 및 대표논문

 박웅양 교수님은 1988년에 서울대학교 의과대학 학사 졸업 후 동 대학원에서 v-FPS 단백질을 연구하였고, 록펠러 대학교에서 박사후 연구원 후 1998년 서울대학교 의과대학에서 교수직으로 임용되었다. 2013년부터 성균관대학교 의과대학의 교수 및 삼성서울병원 삼성유전체연구소 소장으로 재직 중이다. 2016년 국가연구개발성과평가 유공 포상 수여식에서 국무총리 표창, 2019년 제6회 바이오코리아 보건산업 유공자 포상식에서 보건복지구 장관 표창 등의 다양한 수상 경력을 보유하고 있다. 

<대표논문>

■ Linking transcriptional and genetic tumor heterogeneity through allele analysis of single-cell RNA-seq data. Genome Research (28(8), 1217-1227), 2018

■ Prevalence and detection of low-allele-fraction variants in clinical cancer samples. Nature Communications (8(1), 1377), 2017

■ Spatiotemporal genomic architecture informs precision oncology in glioblastoma. Nature Genetics (49(4), 594-599), 2017

■ Single-cell RNA-seq enables comprehensive tumour and immune cell profiling in primary breast cancer. Nature Communications (8, 15081), 2017

■ Application of single-cell RNA sequencing in optimizing a combinatorial therapeutic strategy in metastatic renal cell carcinoma. Genome Biology (17(1), 80), 2016

 3. 연구소 구성팀

■ 연구책임자 : 박웅양

■ 단일세포연구팀 : 이혜옥 외 17명

■ 임상유전체팀 : 정제균 외 9명

■ 유전체분석지원팀 : 정종석 외 12명

■ 빅데이터연구팀 : 김진호 외 6명

■ 연구운영실 : 이묘용 외 4명